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科学研究七十年来，学校充分利用资源优势，结合国家和云南社会经济发展需求，经过几代人的不懈努力，在动植物品种选育、绿色食品产业、地方特色生物产业、环境资源与生态保护、农田水利与节水农业、农业工程与农业信息等方面取得了一批重大科研成果。李铮友教授等率先在国内实现了杂交粳稻“三系”配套，获全国科学大会奖，创造了杂交粳稻单产1108.55千克的世界纪录；曾养志教授等潜心研究西双版纳微型猪近交系近30年，繁育25世代，近交系数达99.47%，居国际领先水平；朱有勇教授等在国际上创建了生物多样性控制作物病害的理论和技术，在云南、四川、贵州、江西等11个省市及东南亚推广应用1.2亿亩，产生了显著的社会经济和生态效益,研究论文在《Nature》作为封面文章全文发表，得到国内外学术界的高度评价和普遍认可。学校还选育了水稻、玉米、甘蔗、马铃薯等新品种近百个，在西南地区及东南亚推广应用1.6亿亩。培育了云南大河猪、滇撒猪配套系、龙陵黄山羊和武定乌骨鸡等畜禽地方品种，推广养殖1.5亿头（只）。2000年以来，学校获得联合国粮农组织（FAO）科学研究一等奖1项，国际农业研究（CGIAR）杰出科学奖1项，何梁何利科学技术进步奖1项，国家技术发明二等奖1项，中国高等学校十大科技进展1项，省部级一等奖11项、二等奖22项、三等奖59项，其他奖项11项，科研成果名列全省高校前茅。目前学校主持全球环境基金（UNEP/GEF）、“973”计划、“863”计划、国家科技支撑计划、国家自然科学基金及省部级等项目642项，在研经费2.62亿余元，为人才强校、科研兴校、科教相长提供了坚实基础。

合作交流学校先后与英、美、日、法、荷、澳、泰、越等32个国家的118个院校和国际研究机构建立了学术交流和科教合作关系。与荷兰瓦赫宁根（Wageningen）大学、越南荣市大学联合招收培养本科生。与英国伍尔夫汉普顿（Wolverhampton）大学、法国里尔（Lille）大学等联合培养硕士生。与日本鹿儿岛大学、京都府立大学、澳大利亚拉筹伯（LaTrobe）大学等互派学生。主持了20余项国际合作科研项目。聘请了116名国内外具有较高学术造诣的院士和专家教授担任客座教授，促进了学校教学科研水平的提高。

精神文明校党政领导、管理部门和教学单位齐抓共管精神文明建设，牢固树立“育人为本，德育为先”观念，全面倡导教书、管理、服务育人，弘扬启发学者、培养正道、潜心耕读、至真至诚的大学精神。涌现出全国优秀共产党员、全国师德先进个人、全国十大“三农”人物、全国民族团结先进个人、云南省十大兴滇人才、云南省十大杰出青年、省部级劳模等100余人。有中共十六大、十七大代表1人，全国人大常委1人。培养出全国优秀大学生、见义勇为英雄大学生杨继斌；全国大学生百名自强之星刘艳华；全国百名优秀大学生胡颖；全国残疾人运动会马拉松比赛冠军韩桂明；首届全国城市电视台业余主持人大赛最佳主持人刘亚萍；全国新丝路杯模特大赛云南赛区冠军徐靖等优秀大学生。大学生暑期“三下乡”社会实践活动连续16年受到团中央表彰，校男子篮球代表队连续20年获云南省高校篮球比赛冠军。近三年全国三好学生、云南省三好学生174人，云南省先进班集体14个，省优秀学生干部53人。学校获全国高校校园文化建设优秀成果奖，被评为全国精神文明建设工作先进单位和云南省德育先进单位。