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学院重视学科建设和科学研究。现有省级重点学科11个，省级医学领先学科19个（含建设学科），院级重点建设学科7个，院级科研机构24个。近三年，学院承担各级科研项目932项，获科研经费1409.55万元，其中，国家自然科学基金项目17项、“973”计划项目2项、“863”项目2项、科技部项目1项，获省级以上科技奖励23项。《医学网络教学研究与应用》获国家级教学成果二等奖。发表论文2789篇，被SCI等收录25篇。学院出版有《江西医学院学报》、《实用临床医学》等2种期刊，其中《江西医学院学报》是全省和全国优秀期刊，被列入中国科技论文统计源期刊和中国医学核心期刊。

学院积极推进开放办学。在国内，与上海交通大学医学院合作办学。在国际，与美国、英国、泰国、加拿大、日本等国家的10余所高等院校和研究机构建立了长期友好合作与交流关系，开展互派人员留学、访问、讲学、学术交流和科研合作等活动。近年来，先后聘请了44名国内外知名学者为客座教授，有数百名外国专家学者来学院访问，派出数百人次出访学习和参加国际学术交流。

八十五年来，学院秉承“德高医精”的院训，发扬“严谨、勤奋、团结、创新”的院风，坚持“质量立院、人才兴院、特色强院”的办学方针，已发展成为江西省医药卫生领域人才培养、科学研究、医疗保健和情报信息的中心，为国家培养了大批的优秀医学人才，为祖国的医学教育事业作出了积极贡献。