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学校在孔子儒学研究领域形成了自己的特色和优势。孔子文化学院是国内最早设立的孔子研究专门机构，学院承担国家社科规划项目、山东省“十五”、“十一五”重点课题多项，办有《儒学研究动态》，每年出版《孔子儒学研究文丛》，多次举办国内外儒学学术会议，广泛进行学术交流，和数十个国家和地区的专家学者建立了学术联系。学院设有以孔子儒学为研究方向的专门史（思想史）硕士点、博士点、博士后科研流动站，培养了一大批高层次的传统文化教学、研究和传播人才。2000年5月15日，依托我校的孔子文化学院和山东省儒学研究基地，我校与中国孔子基金会及海外投资者联合创办了中外合作孔子文化大学。

科学研究

学校把科学研究、创新知识放到突出的战略位置来抓，先后承担了包括国“973”、“863”计划项目在内的一大批高层次科研项目，在中国古代文学、应用数学、孔子儒学、基础数学、激光偏光技术、运筹学、自动化、物理化学、教育科学、体育科学等学科领域达到了较高的水平。“十一五”以来，共获得厅局级以上项目413项，其中国家级项目67项，省部级项目292项，获得项目经费3458.4万元。获得厅局级以上科研奖励302项，省部级以上奖励66项，连续三年获得省社科优秀成果一等奖,2009年获省自然科学二等奖1项。特别是2007年，生命科学学院徐来祥教授获得国家“973计划”项目1项，资助经费450万元，实现了历史性突破，标志着学校的科研水平迈上了一个新台阶。

人才培养

学校始终把人才培养作为学校的根本任务，根据社会发展的需要，积极改革人才培养模式，倡导启发式教学和研究性学习，探索教学理念、培养模式和管理机制的全方位创新。学校积极进行“学分制”改革，目前已经初步形成大专业小方向，双分流培养，科学合理的人才培养模式。并通过品牌专业、特色专业建设、精品课程建设与网络课程建设、试验教学示范中心建设和大学生创新性试验计划的实施，有力推进教育质量的提高和人才培养模式的科学转变。2000年以来，学校应届本科毕业生考研率一直保持在30%以上，少数专业高达67%以上。近年来毕业生就业率均保持在90%左右，毕业生向来以“作风朴实，业务扎实”而受到社会的广泛好评，以宋法棠、王恩多、黄胜、葛立明、李兰蕴等优秀毕业生为代表的曲阜师大学子为国家富强、民族复兴做出了突出的贡献。

学校坚持以先进的教育理念引领教学改革，以系统的教学改革工程培育教学成果。获得国家级教学成果奖6项、省级教学成果奖24项，获奖总数位居山东省省属高校前列。现有汉语言文学、数学与应用数学、教育学和物理学4个国家级特色专业建设点。建成省级精品课程12门，省级品牌特色专业8个。教学水平和教育质量始终保持在全省高校的前列，2004年，在教育部本科教学工作水平评估中，我校本科教学工作得到了教育部专家的高度肯定，获得优秀成绩。