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学校仪器设备精良，目前设备总值19亿多元人民币，其中A、B类设备达90%以上。有着良好的信息化教学环境，拥有装备现代的教学管理指挥中心和电化教学中心，基本实现形态学科实验显微录像化、机能学科实验微机化。教学场所齐全，教室基本实现了空调化、网络化及电子化。新建的4人一间的本科生公寓实现了通学校电话、通网络、通电视，拥有人工草皮的足球场和塑胶跑道的田径场。图书资料丰富，图书馆藏书近253万册（含电子图书68万册），电子期刊2.85万种，现刊约1000种。学校投资数千万元，建成能连通因特网和中国教育科研网的校园网络、先进的光盘检索系统和卫星介导的图书数据库信息检索网络，实现了图书信息资源共享。

学校现有教学、科研、医疗及行政用房81.48万平方米；截止2009年12月31日，学校总资产75.53亿元，其中固定资产66.03亿元（按原始价统计，不含地产），其中教医研设备总值18.9亿元，其中十万元以上的贵重仪器11.9亿。建成了千兆级校园园区网络，所有教室和实验室实现了网络化、空调化、电子化。学生公寓可容纳1.6万名学生，并全部实现了通学校电话、通网络。是军委确认的具有医学情报查新资格的院校之一。

院有包括PET–CT在内的医疗设备9000余台(件)，设备总值达7.9亿元，其中南方医院医疗设备总值4.9亿元。

1985年引进我国第1台，也是东南亚第1台核磁共振仪（MRI）（国内第2台是北京天坛医院），出版了国内第1部MRI专著，制定了国内第1个MRI诊断标准。影像中心是全省几十家中小医院的远程会诊中心，为全国七年制统编教材《医学影像学》的主编单位。

1999年全国首批、广东省首家引进PET，是广东省唯一能自己生产PET显像剂的单位，并供应省人民医院等医院。检查例数已达7300余例，国内最多（第2位是上海华山医院）。

1997年引进华南地区第1套三维适形放疗系统（俗称“光子刀”），已治疗3000余例，居华南地区首位（第2家为中山医肿瘤医院，2001引进，例数约为2000余例）。

1999年10月引进了亚洲第1套氩氦刀治疗系统。

2002年引进国内第1套肿瘤光动力治疗系统，治疗各类肿瘤达200余例，为国内开展例数最多的单位。

学校是国务院首批批准的具有硕士学位授予权的单位，国务院第三批批准的具有博士学位授予权的单位。从1979年开始招收培养硕士研究生，1987年开始招收培养博士研究生。目前学校拥有博士学位授权一级学科6个，博士学位授权一级学科数列全国医学门类博士学位授权单位并列第三位；53个博士学位授权点，65个硕士学位授权点，形成了以医学为主体，理学、工学、法学、管理学、教育学等多学科协调发展的较为完整的学位授权体系。